Co-IP测定是研究蛋白质相互作用的经典技术，它广泛应用于基础生物学研究、药物开发、疾病机制分析等多个领域。这一技术能够帮助研究人员揭示蛋白质在细胞内的功能、信号通路的调控以及其在疾病发生中的作用。Co-IP测定的基本原理是通过利用抗体与目标蛋白特异性结合，捕获目标蛋白及其与之相互作用的蛋白质复合物。该方法结合了免疫学和蛋白质组学的优势，通过免疫沉淀将目标蛋白和与之相互作用的伙伴蛋白从细胞裂解液中分离出来；接下来通过分析这些复合物中的蛋白质成分，研究人员能够识别和确认蛋白质的相互作用关系。在Co-IP测定中，通常需要使用特异性抗体来捕获目标蛋白，这些抗体可能是针对目标蛋白的单克隆抗体、抗原特异性的多克隆抗体或者是针对目标蛋白标签的抗体。捕获后的蛋白质复合物通过亲和柱或磁珠等技术沉淀出来；然后通过多种分析方法（如Western blot、质谱分析等），研究人员可以进一步鉴定与目标蛋白发生相互作用的其他蛋白质。由于许多重要的生物学过程都依赖于蛋白质间的相互作用，这项技术在生命科学研究中占据着不可替代的地位。

一、Co-IP测定的关键步骤

Co-IP测定的实施步骤可以分为以下几个关键环节：

1、样品准备和细胞裂解

样品的质量直接影响到Co-IP测定的结果，因此首先需要确保使用的细胞或组织样本的质量。在裂解细胞时，要确保使用适当的裂解缓冲液，既能有效提取蛋白质又能避免蛋白质在裂解过程中降解。

2、免疫沉淀

将提取的蛋白质与特异性抗体孵育，抗体与目标蛋白结合后，形成抗原-抗体复合物。接下来，通过亲和磁珠、蛋白A/G琼脂糖等载体将抗原-抗体复合物沉淀下来，从而富集目标蛋白及其互作蛋白。

3、洗涤和分离

沉淀后，通过反复洗涤去除非特异性结合的蛋白质，确保得到的复合物是纯净的，洗涤条件的优化对减少背景干扰至关重要。

4、蛋白质鉴定与分析

最后，通过SDS-PAGE凝胶电泳和Western blot等方法分离沉淀中的蛋白质，或者直接进行质谱分析（MS）来鉴定与目标蛋白相互作用的蛋白质。Western blot可以通过抗体验证相互作用蛋白的存在，而质谱分析则能提供更加全面的蛋白质鉴定信息。

二、Co-IP测定的分析方法

在Co-IP测定中，蛋白质复合物的分析通常有以下几种常用方法：

1、Western blot

Western blot是最常用的分析方法，通过抗体识别和标记目标蛋白，可以验证与目标蛋白相互作用的其他蛋白质。通过在凝胶中分离蛋白质，结合膜转移和抗体检测，Western blot能够清晰地展示蛋白质的大小和丰度。

2、质谱分析（Mass Spectrometry, MS）

质谱分析可以提供更加全面的蛋白质鉴定和定量信息。通过质谱仪对蛋白质进行离子化、碎片化并分析其质谱图，可以精确地确定蛋白质的氨基酸序列并识别和定量与目标蛋白相互作用的蛋白质。质谱分析在高通量Co-IP测定实验中尤为重要，能够揭示更复杂的蛋白质互作网络。

3、蛋白质芯片和免疫沉淀实验结合

蛋白质芯片技术能够提供更高通量的蛋白质互作分析，结合Co-IP测定技术，可以在更大范围内筛查蛋白质间的相互作用。

三、Co-IP测定的技术应用

Co-IP测定在多个领域具有重要应用，尤其在揭示蛋白质相互作用网络、疾病研究和药物筛选中发挥着重要作用。

1、基础生物学研究

Co-IP测定是研究蛋白质-蛋白质相互作用的金标准之一。通过构建细胞内蛋白质的相互作用图谱，研究人员可以深入理解细胞内各种信号通路的运作机制，例如研究转录因子如何通过与其他蛋白质的结合，调控基因表达。

2、癌症研究

在癌症研究中，Co-IP测定被广泛应用于发现癌症相关蛋白质及其相互作用伙伴。癌症细胞中常常存在异常的蛋白质相互作用，这些异常的互动可能导致细胞的增殖、迁移和转移。通过Co-IP测定可以鉴定出这些异常的蛋白质相互作用，从而为癌症的早期诊断和治疗提供靶点。

3、药物开发

Co-IP技术对于新药筛选有着重要作用，通过研究药物分子与特定蛋白质的相互作用可以揭示其潜在的生物学效应，此外Co-IP技术还能够帮助鉴定药物靶点和评估药物的特异性和副作用。

4、免疫学研究

Co-IP技术常用于研究免疫信号通路和免疫应答中的蛋白质相互作用，例如，研究T细胞受体与其共刺激分子的相互作用或者肿瘤免疫逃逸过程中免疫抑制分子间的相互作用。

百泰派克生物科技在蛋白质组学研究领域拥有丰富的经验和技术积累，致力于为客户提供专业的Co-IP测定服务。我们提供从实验设计、样品准备、免疫沉淀到数据分析的全流程服务，确保每一项实验都能高效且准确地完成。我们配备了先进的质谱分析设备和高效的蛋白质分析平台，能够帮助客户深入挖掘蛋白质互作网络和信号传导机制，推动科研进展。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

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